El Comité de Mejora Regulatoria Interna (Comeri), se crea a partir del Plan Nacional de Desarrollo 2001-2006, que en una de sus líneas estratégicas establece el impulso de una mejora regulatoria interna en la Administración Pública Federal, que facilite la actividad gubernamental y garantice la aplicación de controles indispensables. Así como también establecer programas de mejora continua en los procesos, organización y desempeño de las instituciones y de los servidores públicos.

En 2003, mediante Acta Constitutiva, se instala formalmente el Comeri en la Comisión Nacional del Agua, teniendo como finalidad simplificar y desregular el marco regulatorio interno y llevar a cabo los cambios que se requieren para que los servidores públicos de la institución puedan operar con mayor facilidad, seguridad, eficiencia y eficacia, teniendo entre sus funciones:

1.       Promover la transparencia y simplificación de las disposiciones internas

2.       Analizar las solicitudes de modificación presentadas por los usuarios y canalizarlas a las áreas emisoras para su consideración

3.       Discutir y aprobar nuevas disposiciones internas que se pretendan aplicar

4.       Evaluar y dictaminar las disposiciones internas presentadas